曲小健
日期： 2022/06/10 作者： 浏览量：
个人简介
曲小健，男，中共党员，副教授，硕士生导师。
围绕寄生植物、裸子植物、禾本科和蓼科植物等植物类群进行了一系列的研究工作，主要利用基因组和转录组数据以及形态学数据开展植物分类、系统发育和进化生物学研究，另外基于生物信息学方法开发实用的基因组学分析软件和工具。在Nature Plants、Molecular Phylogenetics and Evolution、Plant Methods、Genome Biology and Evolution、Frontiers in Plant Science、Plant Disease等本领域主流期刊上发表SCI论文20余篇，其中高水平论文1篇，ESI高被引论文1篇。SCI文章被引600余次。
工作经历
2022.1-至今，16877太阳集团，副教授
2018.9-2021.12，16877太阳集团，讲师
2017.9-2018.8，中科院昆明植物研究所，助理研究员
教育经历
2014.9-2017.7，中科院昆明植物研究所，生物化学与分子生物学，博士
2011.9-2014.7，中科院昆明植物研究所，植物学，硕士
2007.09-2011.7，16877太阳集团，生物技术，学士
研究兴趣和方向
1、结合组学和形态学数据进行植物分类和系统发育基因组学研究，同时解析叶绿体基因组和核基因组的结构进化模式。
2、研究寄生植物适应异养生活方式的进化机制。
3、利用生物信息学方法开发基因组学分析软件和工具。
承担课程
本科生：植物学实验、园林植物学、野外实习
研究生：孢子植物学
主持或参与科研项目情况
1、山东省自然科学基金，结合叶绿体基因组和微条形码研究裸子植物的系统发育关系，2021.1-2023.12，在研，主持。
2、中国博士后科学基金，基于组学数据的裸子植物系统发育和进化研究，2019.7-2021.7，结题，主持。
3、中国科学院“西部青年学者”项目，裸子植物叶绿体基因组系统发育和结构演化研究，2018.1-2020.12，结题，主持。
4、国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目，蔷薇目全球多样化时空格局重建，2018.1-2022.12，在研，参与。
5、国家自然科学基金面上项目，中缅交界高黎贡山种子植物区系及形成原因的进化与生态解释，2016.1-2019.12，结题，参与。
6、国家自然科学基金面上项目，滇藏交界独龙江上游地区种子植物区系与生物多样性保护研究，2014.10-2017.12，结题，参与。
7、国家自然科学基金青年科学基金项目，鼠李科的系统发育研究，2013.1-2015.12，结题，参与。
代表性论文
1. Xiao-Jian Qu†, Xue-Jie Zhang†, Dong-Ling Cao, Xiu-Xiu Guo, Jeffrey P. Mower*, Shou-Jin Fan*. Plastid and mitochondrial phylogenomics reveal correlated substitution rate variation in Koenigia (Polygonoideae, Polygonaceae) and a reduced plastome for Koenigia delicatula including loss of all ndh genes. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2022, https://doi.org/10.1016/j.ympev.2022.107544.
2. Gregory W. Stull†, Xiao-Jian Qu†, Caroline Parins-Fukuchi, Ying-Ying Yang, Jun-Bo Yang, Zhi-Yun Yang, Yi Hu, Hong Ma, Pamela S. Soltis, Douglas E. Soltis, De-Zhu Li*, Stephen A. Smith*, Ting-Shuang Yi*. Gene duplications and phylogenomic conflict underlie major pulses of phenotypic evolution in gymnosperms. Nature Plants, 2021, 7, 1015–1025.
3. Xiao-Jian Qu, Michael J. Moore, De-Zhu Li*, Ting-Shuang Yi*. PGA: a software package for rapid, accurate, and fexible batch annotation of plastomes. Plant Methods, 2019, 15:1.
4. Xiao-Jian Qu, Shou-Jin Fan, Susann Wicke*, Ting-Shuang Yi*. Plastome reduction in the only parasitic gymnosperm Parasitaxus is due to losses of photosynthesis but not housekeeping genes and apparently involves the secondary gain of a large inverted repeat. Genome Biology and Evolution, 2019, 11(10):2789-2796.
5. Xiao-Jian Qu, Chung-Shien Wu, Shu-Miaw Chaw*, Ting-Shuang Yi*. Insights into the existence of isomeric plastomes in Cupressoideae (Cupressaceae). Genome Biology and Evolution, 2017, 9(4): 1110-1119.
6. Xiao-Jian Qu*, Shou-Jin Fan*. First report of the parasitic invasive weed field dodder (Cuscuta campestris) parasitizing the confamilial invasive weed common morning-glory (Ipomoea purpurea) in Shandong, China. Plant Disease, 2021, 105:1230.
7. Xiao-Jian Qu, Jian-Jun Jin, Shu-Miaw Chaw, De-Zhu Li*, Ting-Shuang Yi*. Multiple measures could alleviate long-branch attraction in phylogenomic reconstruction of Cupressoideae (Cupressaceae). Scientific Reports, 2017, 7: 41005.
8. Xiao-Jian Qu, Shou-Jin Fan*. First report of leaf wilt caused by Cuscuta japonica on generally insusceptible host plant Rhus typhina in China. Plant Disease, 2020, 104:11.
9. Xiao-Jian Qu, Li-Kang Liu, Luo-Yan Zhang, Xue-Jie Zhang, Shou-Jin Fan*. First report of dodder (Cuscuta japonica) parasitizing Japanese red pine (Pinus densiflora) in China. Plant Disease, 2020, 104:6.
10. Rong Wang, Kuan Liu, Xue-Jie Zhang, Wen-Li Chen, Xiao-Jian Qu*, Shou-Jin Fan*. Comparative plastomes and phylogenetic analysis of Cleistogenes and closely related genera (Poaceae). Frontiers in Plant Science, 2021, 12:638597.
11. Xiu-Xiu Guo†, Xiao-Jian Qu†, Xue-Jie Zhang*, Shou-Jin Fan*. Comparative and phylogenetic analysis of complete plastomes among Aristidoideae species (Poaceae). Biology, 2022, 11, 63.
12. Lei Zhao, Ying-Ying Yang, Xiao-Jian Qu, Hong Ma, Yi Hu, Hong-Tao Li, Ting-Shuang Yi*, and De-Zhu Li*. Phylotranscriptomic analyses reveal multiple whole-genome duplication events, the history of diversification and adaptations in the Araceae. Annals of Botany, 2022, mcac062, https://doi.org/10.1093/aob/mcac062.
13. Kuan Liu, Rong Wang, Xiu-Xiu Guo, Xue-Jie Zhang, Xiao-Jian Qu*, Shou-Jin Fan*. Comparative and phylogenetic analysis of complete chloroplast genomes in Eragrostideae (Chloridoideae, Poaceae). Plants, 2021, 10(1):109.
14. Ying-Ying Yang, Xiao-Jian Qu, Rong Zhang, Gregory W. Stull*, Ting-Shuang Yi*. Plastid phylogenomic analyses of Fagales reveal signatures of conflict and ancient chloroplast capture. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2021, 163, 107232.
15. Zhi-Fang Liu, Hui Ma, Xiu-Qin Ci, Lang Li, Yu Song, Bing Liu, His-Wen Li, Shu-Li Wang, Xiao-Jian Qu, Jian-Lin Hu, Xiao-Yan Zhang, John G. Conran, Alex D. Twyford*, Jun-Bo Yang*, Peter M. Hollingsworth*, Jie Li*. Can plastid genome sequencing be used for species identification in Lauraceae? Botanical Journal of the Linnean Society, 2021, 197, 1:1-14.
代表性著作
《16877太阳集团珍藏植物科学绘图》，副主编
《16877太阳集团校园植物图志》，编委
获奖情况
16877太阳集团本科优秀毕业论文指导教师
联系方式
16877太阳集团长清湖校区博物楼A座434
